Según la Guía de Auditoría Territorial (GAT) versión 4.0, la conformación del Comité Técnico de Auditorías en las Contralorías Territoriales debe adaptarse a su estructura organizacional y disponibilidad de personal, reconociendo que no siempre se dispone de los perfiles profesionales requeridos. La GAT permite que cada Contraloría Territorial defina la metodología y conformación del comité acorde con sus necesidades, manteniendo la autonomía para establecer su estructura mediante acto administrativo del Contralor Territorial. Los comités pueden incluir profesionales y técnicos disponibles, y aunque se recomienda la constitución técnica y colegiada, en casos de limitación de personal, se admite la participación de integrantes no estrictamente técnicos. En situaciones de empate o impedimento, las decisiones finales recaen en el líder de la dependencia que ejerce la vigilancia y control fiscal, garantizando la continuidad del proceso auditor y la legitimidad en la toma de decisiones.