El Fondo, adscrito al Ministerio de Agricultura, tendrá como propósito promover el desarrollo sostenible del sector, mejorar su competitividad y productividad e impulsar la investigación y la innovación tecnológica. Sus recursos se destinarán a programas de investigación, comercialización, exportación, formación, sostenibilidad ambiental y agregación de valor. Su administración será delegada inicialmente a FEDECOCO, bajo la supervisión del Ministerio de Agricultura y de un Comité Directivo, con el fin de garantizar la transparencia y eficiencia en el manejo de los recursos.