El seguimiento y control del PSMV corresponde a la autoridad ambiental, que realiza verificación semestral del avance físico y anual de la reducción de carga contaminante, con informes entregados por el prestador del servicio público de alcantarillado. La Superintendencia de Servicios Públicos verifica el cumplimiento de metas del POIR, que incluye proyectos del PSMV, y reporta avances semestrales. El incumplimiento por parte del prestador activa medidas preventivas y sancionatorias conforme al artículo 85 de la Ley 99 de 1993, y la Superintendencia es la autoridad competente para vigilancia, recibiendo reportes ciudadanos sobre fallas en la ejecución. Además, no cumplir con las inversiones obliga al prestador a calcular y provisionar diferencias entre inversiones planeadas y ejecutadas.